Протягом 2013-2015 рр. в Нацагентстві з акредитації України діяли відпрацьовані корупційні схеми: викуп посад директорами, щомісячні внески і підконтрольна приватна асоціація. Цю діяльність працівники агентства пов’язують із її колишнім керівником Володимиром Рущаком. Екс-голова нещодавно втік з України і зараз займається питанням акредитації Росії.